Ma on jednak proste wyjaśnienie – najprostsze eukarioty takie jak grzyby mają geny w genomach położone bliżej siebie, oszczędniej wykorzystana jest w nich przestrzeń. Genom kręgowców czy roślin kwiatowych nie jest taki zwarty, a stopień zagęszczenia genów może być różny, zarówno między gatunkami, jak i w obrębie chromosomu. W chromosomach człowieka zagęszczenie to waha się w zakresie 0–64 genów na 100 kpz. Genom ryby Tetraodon nigroviridis zawiera mniej niż 400 mln pz, czyli 1/8 wielkości genomu człowieka, a jednak koduje podobną liczbę genów.
U roślin osiowych według stanu wiedzy na 2018 zarówno najmniejszy, jak i największy genom występował u okrytonasiennych – odpowiednio 61 Mpz u Genlisea tuberosa z rodziny pływaczowatych i 149 Gpz u Paris japonica. Niewiele mniejszy zakres stwierdzono u paproci – od 748 Mpz u Azolla microphylla do 147 Gpz u Tmesipteris obliqua. W 2024 odkryto jeszcze większy genom w innym gatunku paproci psylotowatej Tmesipteris truncata – 160 miliardów par zasad (50 × więcej niż genom człowieka).