informacje wymagają dalszej weryfikacji.
Obecnie (2021) Międzynarodowy Komitet Ornitologiczny (IOC) umieszcza wodnika brązowego w monotypowym rodzaju Cabalus, podobnie jak wielu innych współczesnych autorów. Rok po opisaniu gatunku przez Huttona ten sam autor wydzielił go do utworzonego dlań rodzaju Cabalus po przeanalizowaniu szkieletu, jaki przygotował doktor F. Knox. Do artykułu była dołączona ilustracja przedstawiająca budowę mostka wodnika brązowego. Niedługo po odkryciu sądzono, że nowo odkryty ptak to młodociany wodnik chathamski (Hypotaenidia dieffenbachii). Hutton rok po opisaniu gatunku przedstawił jednak dowody zaprzeczające tej hipotezie. Na przestrzeni lat gatunek umieszczany bywał w rodzajach Rallus i Gallirallus, jak to np. uczynili autorzy Handbook of Australian, New Zealand & Antarctic Birds (1993) czy IOC we wcześniejszych wersjach swojej listy. Badania Trewicka z 1997, obejmujące analizę zarówno mtDNA, jak i budowy ciała badanych chruścieli, wskazują jednak na konieczność wyodrębniania wodnika brązowego ze względu na jego bardzo odmienną budowę oraz na bliskie pokrewieństwo z wymarłym wodnikiem chathamskim (Hypotaenidia dieffenbachii). IOC uznaje ten gatunek za monotypowy.