przedstawił naczelnemu lekarzowi SS Grawitzowi propozycję doświadczeń na 20 więźniach obozu w Buchenwaldzie. Według powojennych zeznań Mrugowskyego przebieg działań wojennych uniemożliwił ich wykonanieStanisław Sterkowicz, Zbrodnie hitlerowskiej medycyny Warszawa „Bellona”, 1990, , s. 83..
30 kwietnia 1945, opiekując się rannymi w berlińskim szpitalu, został pojmany przez Rosjan i wywieziony do Związku Radzieckiego. 26 sierpnia 1946 niespodziewanie wystąpił jako świadek w procesie norymberskim, wspomagając swoimi zeznaniami sowieckiego głównego prokuratora, Romana Rudienkę w procesie przeciwko Hermannowi Göringowi i Kurtowi Blomemu, którzy byli oskarżeni o rozwijanie niemieckiej ofensywnej broni biologicznej. Zapis jego zeznań znajduje się w internetowym archiwum Imperial War MuseumInternational Military Tribunal, Nuremberg: Day 211 26/8/1946 Walter Schreiber questioned. Audio Recordings, Imperial War Museum, London.. Zostały one uznane za dowód w procesach norymberskich przeciwko największym zbrodniarzom wojennymTranscripts, Trial of German Major War Criminals Nuremberg, Germany, August 26, 1946.. Sam Schreiber nie został postawiony w stan oskarżenia za zbrodnie wojenne.