Nastał okres rozwoju i zmian organizacyjnych. W 1992 przekształcono szkołę z liceum zawodowego w liceum ogólnokształcące o profilu matematyczno-fizycznym, powstały nowe klasopracownie. mały|Pomnik Bohaterskim Lotnikom Dęblińskiej Szkoły Orląt i Liceum Lot. mały|Liceum Lotnicze przy LAW – rektorat W 1997 dyrektorem został ppłk pil. Andrzej Krajewski. Szkoła była zagrożona likwidacją, zmniejszyła się liczba uczniów, redukowano zatrudnienie. Liceum przeszło kompleksową wizytację dokonaną przez Kuratorium Oświaty i Wychowania w Lublinie. Wynik kontroli był bardzo dobry. Z dniem 1 września 2003 przekształcono Ogólnokształcące Liceum Lotnicze im. Żwirki i Wigury w Dęblinie w ponadgimnazjalne Ogólnokształcące Liceum Lotnicze im. Franciszka Żwirki i Stanisława Wigury w DęblinieZarządzenie nr 4/MON Ministra Obrony Narodowej z dnia 28 lutego 2003 r.. W roku szkolnym 2003/2004 zmniejszono nabór uczniów do klas pierwszych, wprowadzono trzyletni cykl kształcenia oraz realizację rozszerzonych programów nauczania z wybranych przedmiotów. W 2006 stanowisko dyrektora ponownie objął płk pil. Janusz Ziółkowski. Od września 2007 w liceum lotniczym zorganizowano po raz pierwszy klasy w których naukę rozpoczęły uczennice. Od września 2010 Szkołę przeniesiono do budynku „Puchacz”, w którym znajduje się część dydaktyczna i internat.