Życiorys Eufrozyn Sagan urodził się 8 października 1916 roku w Oświęcimiu. Z racji zawodu ojca Andrzeja, który był cenionym lekarzem weterynarii, rodzina Saganów musiała często zmieniać miejsce zamieszkania. W 1924 roku Eufrozyn Sagan rozpoczął naukę w szkole powszechnej w Nowym Sączu. Dwa lata później wraz z rodziną powrócił do Oświęcimia, gdzie ukończył czwartą klasę szkoły powszechnej i kontynuował naukę w Gimnazjum Koedukacyjnym im. Księdza Stanisława Konarskiego. Maturę zdał w 1935 roku, zaczynając rok później studia przyrodnicze na Uniwersytecie Poznańskim. W 1937 roku przeniósł się do Lwowa, na tamtejszy Uniwersytet im. Jana Kazimierza, w którym kontynuował studia na wydziale matematyczno-przyrodniczym. jego wykładowcami byli m.in. antropolog Jan Czekanowski, logik i matematyk Leon Chwistek, botanik Stanisław Kulczyński i geolog Jan Samsonowicz. Dalszą edukację Eufrozyna Sagana przerwał wybuch drugiej wojny światowej.