Od listopada 1990 do stycznia 1993 był wicedyrektorem Departamentu Europy Ministerstwa Spraw Zagranicznych, równocześnie od października 1991 do grudnia 1992 dyrektorem Polskiego Instytutu Spraw Międzynarodowych, od lutego do grudnia 1993 dyrektorem Departamentu Studiów Strategicznych Ministerstwa Obrony Narodowej. Od 1994 pracuje w Instytucie Studiów Politycznych PANAntoni Kamiński Curriculum vitae, gdzie kieruje Zakładem Bezpieczeństwa Międzynarodowego i Studiów Strategicznych. 31 marca 1993 otrzymał tytuł profesora nauk humanistycznych. Był także wykładowcą Collegium Civitas.

W latach 1997–1998 wchodził w skład Rady do spraw Reformy Państwa przy Prezesie Rady Ministrów, w latach 2006-2008 był członkiem Rady Administracji Publicznej przy Prezesie Rady Ministrów, w 2015 został członkiem Narodowej Rady RozwojuBiogram na stronie prezydent.pl. 15 grudnia 2021 powołany w skład Rady ds. Bezpieczeństwa i Obronności przy Prezydencie RP, w której zasiadał do 2025.

Był założycielem i w latach 1999-2001 pierwszym prezesem polskiego oddziału Transparency International.