Etap drugi to właściwe szyfrowanie. VIC był połączeniem szyfru podstawieniowego z przestawieniowym. Przy pomocy szachownicy tekst jest zamieniany na ciąg cyfr, który następnie w dwóch tablicach ulega przemieszaniu (przez przestawienie kolumn) usuwającemu wszelkie powiązania między cyframi. Na końcu uzyskany ciąg cyfr był dzielony na pięciocyfrowe grupy, dodawano w ustalonym miejscu grupę jednorazową i całość była zapisywana jako ostateczna wersja tekstu zaszyfrowanego. W tej postaci tekst był nadawany przez radio lub pozostawiany w umówionym miejscu jako zmniejszona fotokopia. Aby zaoszczędzić pracy odbiorcy oraz umożliwić sprawdzenie, czy przekaz został odebrany w całości, jako nagłówek wiadomości podawano ilość 5-cyfrowych grup.
Tworzenie kluczy i tablic VIC był opracowany do szyfrowania tekstów rosyjskich pisanych cyrylicą. W poniższym przykładzie zmodyfikowano niektóre elementy (np. szachownicę z rozwidleniem), żeby umożliwić użycie polskiego alfabetu.
Najpierw od wymyślonej grupy cyfr należy odjąć (modulo 10) pierwsze pięć cyfr stałej sześciocyfrowej grupy. 2 7 1 8 5 9 4 1 9 033095