Od 6 kwietnia 2009 do 18 marca 2013 roku wiceminister zdrowia w drugim rządzie Binjamina Netanjahu. Powrócił na to stanowisko 19 maja 2015 roku w czwartym rządzie Binjamina Netanjahu, sprawował je do 2 września tegoż roku, kiedy to stanął na czele resortu. Pozostał na stanowisku do 28 listopada 2017 roku.
W kwietniu 2020 roku Ja’akow Litzman stał się tematem doniesień medialnych, gdy wykryto infekcję koronawirusem zarówno u niego i jego żony. Według niektórych mediów miał wcześniej twierdzić, że pandemia COVID-19 jest karą od Boga za homoseksualizmMinister zdrowia Izraela jest zakażony koronawirusem, serwis internetowy tygodnika "Rzeczpospolita", 2020-04-2, dostęp 2020-04-09. O ile Litzman faktycznie ma niepochlebną opinię na temat homoseksualizmu, informacja o tym, że miał obarczyć go winą za koronawirusa, okazała się fake newsem.
17 maja 2020 roku zaprzysiężony jako minister budownictwa i mieszkalnictwa. 13 września tego samego roku zrezygnował ze stanowiska w ramach protestu przeciwko planom wprowadzenia w Izraelu tzw. lockdownu w okresie świąt Rosz ha-Szana, Jom Kipur i Sukkot. W listopadzie 2020 roku został ponownie mianowany ministrem budownictwa.