W debiutanckim sezonie 2017/2018 w Bundeslidze rozegrał wszystkie 34 mecze ligowe, co przyniosło mu w sierpniu 2018 roku przedłużenie kontraktu.
W sezonie 2021/2022 klub spadł do 2. Bundesligi, a Pavlenka rozegrał w niej 23 mecze. Po wywalczeniu awansu wrócił z Werderem do najwyższej klasy rozgrywkowej. W sezonie 2023/2024, po 7. kolejce, utracił miejsce pierwszego bramkarza na rzecz Michaela Zettererera i nie wystąpił już w żadnym kolejnym spotkaniu. W maju 2024 roku klub ogłosił, że nie przedłuży wygasającego kontraktu zawodnika. Po siedmiu latach Pavlenka opuścił Breme jako wolny zawodnik, mając na koncie łącznie 221 meczów we wszystkich rozgrywkach, 28 czystych kont i 582 obrony w 175 ligowych spotkaniach.
PAOK Saloniki (2024–) 30 września 2024 roku, jako wolny zawodnik, Pavlenka podpisał kontrakt z broniącym tytułu mistrzem Grecji – PAOK Saloniki. Umowa opiewała na rok z opcją przedłużenia o kolejny sezon. W czerwcu 2025 roku kontrakt został przedłużony do 30 czerwca 2027.
Kariera reprezentacyjna Pavlenka reprezentował Czechy na szczeblu młodzieżowym (U-21) w latach 2013–2015. W marcu 2015 roku otrzymał pierwsze powołanie do seniorskiej kadry na mecz towarzyski ze Słowacją. W seniorskiej reprezentacji zadebiutował 15 listopada 2016 roku w towarzyskim meczu z Danią (1:1), wchodząc w 46.