W 1924 cerkiew została zamknięta, a rok później przetopiono znajdujące się w niej dzwony. Początkowo w nieczynnej świątyni urządzono magazyn, następnie cerkiew przekazano utworzonemu w 1959 Jarosławskiemu Muzeum-Rezerwatowi Historii, Architektury i Sztuki. W 1992 Rosyjski Kościół Prawosławny odzyskał budynek, zaś dwa lata później w obiekcie odprawiono pierwszą od 70 lat Świętą Liturgię. Od 1995 jest siedzibą parafii garnizonowej. Nabożeństwa odbywają się jednak jedynie w bocznym ołtarzu Zwiastowania.
Architektura Pod względem rozplanowania przestrzennego cerkiew św. Michała Archanioła przypomina starsze świątynie św. Mikołaja Nadieina oraz św. Eliasza. Z czterech stron główną czworoboczną nawę otaczają galerie. Dzwonnica cerkiewna położona jest w północno-zachodnim narożniku budynku i zwieńczona jest wysokim dachem namiotowym. Pomieszczenie ołtarzowe budynku zamknięte jest trzema absydami. Całą cerkiew posadowiono na wysokim podklecie, w którym znajdował się kupiecki magazyn. Elewacje cerkwi zdobione są typowymi dla architektury jarosławskiej ornamentami.
Cerkiew od początku posiadała drugi ołtarz – świętych Zozyma i Sawwacjusza Sołowieckich.