W grze dostępne są trzy poziomy trudności, wpływające na zdrowie przeciwników i zadawane przez nich obrażenia – zwykły, heroiczny i mistrzowski. System rzemiosła pozwala na tworzenie przedmiotów leczniczych, wzmacniających, strojów i artefaktów ze znajdowanych surowców, takich jak taśma klejąca, klej, butelki po napojach izotonicznych czy placki taco. Wśród aktywności dodatkowych znajdują się m.in. wypróżnianie się w napotkanych toaletach, znajdowanie rysunków yaoi przedstawiających Tweeka i Craiga czy robienie selfies z mieszkańcami w celu zwiększenia liczby obserwujących na Szopstagramie – superbohaterskim odpowiedniku Instagramu. Ukończenie niektórych misji fabularnych możliwe jest dopiero po zgromadzeniu odpowiedniej liczby obserwujących. Smartfon postaci służy za menu gry, pozwalające zarządzać ekwipunkiem, profilem postaci czy sprawdzać dostępne zadania.
Opis Świat gry thumb|Trey Parker (po prawej) i Matt Stone, twórcy Miasteczka South Park, udzielający też głosów większości postaci w grze. Akcja South Park: The Fractured but Whole rozgrywa się w fikcyjnym miasteczku South Park w stanie Kolorado dzień po wydarzeniach z poprzedniczki. Gracz ponownie wciela się w milczącego protagonistę, Nowego.