W latach 2005–2007 zakład (część mieszkalna dla osadzonych) przeszedł kolejny gruntowny remont. W części mieszkalnej oprócz generalnego remontu cel, wygospodarowano miejsce na kantynę dla osadzonych, wyremontowano również pomieszczenia biblioteki, radiowęzła i kaplicę. W roku 2005 zlikwidowano Szpital Chorób Płucnych przy Zakładzie Karnym w Cieszynie, tym samym zwiększyła się pojemność, która obecnie wynosi 406 miejsc. Wszystkie cele posiadają wyodrębnione, zamykane kąciki sanitarne, wyposażone są w głośniki radiowęzła oraz domofony umożliwiające kontakt z funkcjonariuszem pełniącym służbę w oddziale, a także przyłącza, umożliwiające odbiór sygnału telewizyjnego.
W 2008 roku więźniowie cieszyńskiego Zakładu Karnego wykonywali prace dla Miejskiego Zarząd Dróg w Cieszynie. W nieodpłatnych pracach interwencyjnych wzięło udział od sześciu do ośmiu skazanych, którzy zajmowali się głównie czyszczeniem rowów melioracyjnych i sprzątaniem.
3 czerwca 2009 roku o godzinie 22.00 w więzieniu, a dokładnie na jego murach, zorganizowano Wideoinstalację na murze cieszyńskiego więzienia, której autorami byli Jarosław Skutnik i Adam Molenda.