Od 1963 jezioro Hańcza wraz ze skarpą jest rezerwatem krajobrazowo-wodnym.
Roślinność Roślinność zanurzona reprezentowana jest głównie przez ramienicowce: ramienica szorstka Chara aspera, ramienica zwyczajna C. rudis, ramienica przeciwstawna C. contraria, ramienica grzywiasta C. jubata, ramienica szczeciniasta C. strigosa, rdestnica Potamogeton.
Roślinność wynurzona (helofity) reprezentowana jest przez: trzcina pospolita Phragmites australis, oczeret jeziorny Schoenoplectus lacustris, pałka wąskolistna Typha angustifolia, skrzyp bagienny Equisetum limosum, tatarak zwyczajny Acorus calamus, turzyca błotna Carex acutiformis.
Fauna W jeziorze występują gatunki ryb charakterystyczne dla zimnych wód północnych oraz potoków górskich, takie jak: miętus pospolity oraz głowacz pręgopłetwy i głowacz białopłetwy, a także sieja wigierska, sielawa, stynka. Jezioro Hańcza jest jedynym zbiornikiem, gdzie zachowała się jeszcze w czystej formie populacja siei wigierskiej Coregonus lavaretus maraena natio vigrensis.