Od 1971 był członkiem Obywatelskiego Komitetu Odbudowy Zamku Królewskiego w Warszawie"Biuletyn Zamek", nr 17a, 19 czerwca 1971, s. 5..
Został pochowany na cmentarzu Wojskowym na Powązkach (kwatera C4-tuje-12). Dla uczczenia pamięci prof. Jana Z. Jakubowskiego minister oświaty i wychowania ufundował w 1976 doroczną nagrodę jego imieniaNagrody czekają na laureatów konkursu "Maturzyści - 76, "Życie Warszawy", nr 127, 29 maja 1976, s. 1..
Odznaczenia Order Sztandaru Pracy I klasy"Trybuna Ludu", nr 239, 15 października 1975, s. 4. Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski"Trybuna Ludu", nr 239, 15 października 1975, s. 4. Krzyż Oficerski Orderu Odrodzenia Polski (1965) Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski (1956) Medal Komisji Edukacji Narodowej (1970) Brązowy Medal „Za zasługi dla obronności kraju” (1967)Za zasługi dla obronności Kraju, „Za Wolność i Lud”, nr 11, 1 czerwca 1967, s. 1-2. Medal pamiątkowy z okazji 200-lecia Komisji Edukacji Narodowej (1974)Posiedzenie rady redakcyjnej "Oświaty i Wychowania, "Życie Warszawy", nr 73, 27 marca 1974, s. 2.
Życie prywatne Żonaty, żona Zofia Jakubowska (1907−2001).