Uruchomienie czasopisma naukowego dedykowanego regionowi było związane z utworzeniem w mieście w 1956 oddziału Polskiego Towarzystwa Historycznego, które uzyskało wsparcie oraz poparcie Mariana Biskupa. Z czasem większość prac redakcyjnych zaczęła być przenoszona do Muzeum w Grudziądzu co spowodowało spadkiem udziału PTH w redagowaniu Rocznika Grudziądzkiego, a na początku wieku XXI grudziądzkie muzeum nawiązało współpracę z Instytutem Historii i Archiwistyki Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu. Zarówno Instytut, jak i Muzeum odpowiedzialne są za finansowanie oraz redagowanie rocznika.
W roku 2020 Rocznik Grudziądzki został dodany do bazy czasopism (European Reference Index for the Humanities and Social Sciences).
Rocznik Grudziądzki należy czasopism punktowanych i za opublikowanie artykułu można otrzymać 40 punktów. Punktacja ta przysługuje (od 05.01.2024 r.) w zakresie dyscyplin jakimi są archeologia, historia oraz nauki o sztuce.
W Muzeum w Grudziądzu w związku z publikacjami Rocznika Grudziądzkiego odbywały się promocje numerów. Podczas tych promocji odbywały się tematyczne wystąpienia.
Redaktorzy naczelni czasopisma i numery czasopisma