Szata roślinna Flora rezerwatu obejmuje ok. 1100 gatunków roślin, w tym 70 gatunków ujętych w armeńskiej czerwonej księdze roślin. Rośnie tu szereg endemitów, zwykle wyróżniających się nazwą gatunkową od nazwy Gór Zangezurskich, np.: Pyrus zangezura, Campanula zangezura, Thlaspi zangezurum. Lasy do 1000 m n.p.m. tworzy głównie Quercus × mannifera (=Q. araxina). Występują tu także zarośla nawiązujące do typowej dla wschodniej części obszaru śródziemnomorskiego formacji sziblak. Porastają one strome, skaliste i suche stoki gór. Dominuje w nich ciernisty dwukolczak śródziemnomorski Paliurus spina-christi, a towarzyszą mu: perukowiec podolski Cotinus coggygria, berberys pospolity Berberis vulgaris, Celtis iguanaea i inne krzewy termofilne. W runie dominuje palczatka kosmata Bothriochloa ischaemum.