Trasa przebiega przez pięć parków narodowych: Wigierski Park Narodowy, Biebrzański Park Narodowy, Narwiański Park Narodowy, Białowieski Park Narodowy i Roztoczański Park Narodowy. Ponadto prowadzi przez 15 parków krajobrazowych i 26 obszarów specjalnej ochrony ptaków.
Na zdecydowanej większości trasy szlak biegnie po obszarach nizinnych. Według materiałów organizatora niemal 580 km szlaku przebiega przez tereny leśne, a około 180 km przez doliny rzeczne. Wyjątkiem są bardziej wymagające odcinki na Podkarpaciu, w tym odcinek Rzeszów–Przemyśl prowadzący przez Pogórze Dynowskie i Pogórze Przemyskie. NIK również wskazywała, że większość szlaku nie wymaga szczególnych umiejętności ani dużego wysiłku, z wyjątkiem górskich odcinków podkarpackich.
thumb|Wydzielona droga dla rowerów na szlaku Green Velo w Glitajnach w województwie warmińsko-mazurskim
Rowerowe Królestwa Na potrzeby rozwoju oferty turystycznej obszary wokół Green Velo podzielono na 12 tzw. „Królestw Rowerowych”.