Nie zaowocowało to jednak powrotem do pierwszej ligi.
Latem 2008 Pinto został zawodnikiem innego drugoligowca – ekipy Querétaro FC, gdzie z miejsca został ważnym ogniwem defensywy i już w sezonie Apertura 2008 triumfował w rozgrywkach Primera División A, zaś na koniec rozgrywek 2008/2009 awansował do najwyższej klasy rozgrywkowej. Tam, 14 listopada 2009 w wygranej 4:0 konfrontacji z San Luis, strzelił swojego premierowego gola w pierwszej lidze, jednak jednocześnie został relegowany do roli rezerwowego, którą pełnił przez kolejne półtora roku. W styczniu 2011 udał się na wypożyczenie do drugoligowego Tiburones Rojos de Veracruz, gdzie bez poważniejszych osiągnięć występował przez sześć miesięcy, po czym został wypożyczony do innego drugoligowca – tym razem CD Irapuato, którego barwy również reprezentował przez półrocze. Później – również na zasadzie wypożyczenia – powrócił do drugoligowego Dorados de Sinaloa, gdzie spędził półtora roku; w sezonie Apertura 2012 jako kluczowy defensor doszedł do finału rozgrywek ligowych oraz zdobył puchar Meksyku – Copa MX.