Kariera trenerska Po zakończeniu kariery piłkarza rozpoczął pracę szkoleniowca. W 2000 ukończył Wyższą Szkołę Trenerów w Moskwie i pracował jako asystent trenera w Access-Golden Grane Petropawł. W 2004 prowadził Ekibastuziec Ekibastuz. 30 kwietnia 2004 roku został mianowany na selekcjonera narodowej reprezentacji KazachstanuУ сборной Казахстана – новый тренер – Football.By, którą kierował do 9 listopada 2005. Zespół pod jego kierownictwem rozegrał 13 gierСборная Казахстана – КАЗАХСТАНСКИЙ ФУТБОЛ | KAZ-Football.kz | ФУТБОЛ КАЗАХСТАНА. Od czerwca do końca 2005 również stał na czele FK Atyrau. W 2006 pomagał trenować FK Rostow. W 2007 pracował jako administrator w Sodowiku Sterlitamak. Od 11 września 2008 do 13 października 2008 obejmował stanowisko głównego trenera FK Łuchowicy, a w 2009 (do 7 czerwca) pracował jako asystent trenera w sztabie szkoleniowym klubu MWD Rossii-Kryłatskoje Moskwa. Od 11 stycznia do 18 sierpnia 2010 kierował Sachalinem Jużnosachalińsk, a 11 stycznia 2011 do 16 marca 2012 trenował Mostowik-Primorje Ussuryjsk. Od 27 września 2012 do 1 maja 2014 ponownie stał na czele Sachalinu JużnosachalińskСергей ТИМОФЕЕВ: "Я – футбольный вандал" | Газета | Караван. 5 stycznia 2016 objął stanowisko dyrektora technicznego klubu Ałtaj SemejПервая лига.