Oddział Kliniczny Medycyny Ratunkowej (przyjęcia w trybie nagłym i rejestracja w trybie planowym) Oddział Kliniczny Ortopedii i Traumatologii Narządu Ruchu (z Pododdziałem Wczesnej Rehabilitacji Narządu Ruchu) Oddział Anestezjologii i Intensywnej Terapii Centrum Jednodniowej Terapii Hematologicznej Centrum Terapii Onkologicznej
Zakłady Zakład Diagnostyki Laboratoryjnej Zakład Endokrynologii i Diabetologii Zakład Krwiolecznictwa Zakład Mikrobiologii Klinicznej i Diagnostyki Molekularnej Zakład Patomorfologii, Placentologii i Hematopatologii Klinicznej Zakład Rehabilitacji Zakład Radiologii i Diagnostyki Obrazowej
Przychodnie, poradnie i pracownie W szpitalu znajduje się Przychodnia Alergologiczna z Pracownią Badań Czynnościowych Układu Oddechowego, Przychodnia Foniatryczno-Audiologiczna oraz 75 poradni specjalistycznych i pracowni dla dzieci i dorosłych.
Patron Patronem szpitala od kwietnia 1990 roku jest dr Jan Biziel (1858–1934) – lekarz i społecznik, uczestniczący w organizacji władz polskich w Bydgoszczy po odzyskaniu niepodległości.