W latach 1980–1981 wydawnictwo częściowo zmieniło charakter edytorski. Poza beletrystyką, pracami naukowymi i popularnonaukowymi Wydawnictwo Morskie zaczęło dodatkowo publikować zagadnienia związane z aktualną sytuacją na Wybrzeżu. Wydrukowano 2 wydania albumu „Solidarność” ze zdjęciami ze strajku sierpniowego, pracę zbiorową poświęconą o Lechowi Wałęsie, oraz najważniejsze fragmenty obrad plenum Międzyzakładowego Komitetu Strajkowego w Stoczni Gdańskiej. Działalność ta przyczyniła się do wszczętej w marcu 1982 roku weryfikacji pracowników. Wydawnictwo Morskie było jedynym wydawnictwem w Polsce, które poddano weryfikacji, w ramach której każdy z redaktorów był przesłuchany indywidualnie przez zespół osób z gdańskiego Komitetu Wojewódzkiego PZPR, Marynarki Wojennej, Komitetu Wojewódzkiego MO, Ministerstwa Kultury i Sztuki oraz Gdańskiego Urzędu Kontroli Publikacji i Widowisk.
7 grudnia 1992 roku ogłoszono upadłość Wydawnictwa Morskiego.