Jesienią tego samego roku otrzymał od prof. Stanisława Kulczyńskiego propozycję stworzenia od podstaw Wydziału Weterynaryjnego na połączonych Uniwersytecie i Politechnice Wrocławskiej, pracę rozpoczął 1 listopada 1945. Przez dwa lata pełnił funkcję pierwszego dziekana Wydziału Weterynaryjnego, a także kierownika Katedr Patologii i Terapii Szczegółowej, Diagnostyki Chorób Wewnętrznych i Epizootiologii. W 1947 ze względów zdrowotnych ograniczył pracę naukową, zmarł cztery lata później. Został pochowany na cmentarzu św. Wawrzyńca we Wrocławiu. mały|Grób prof. Zygmunta Markowskiego na cmentarzu św. Wawrzyńca we Wrocławiu (4d / A / 14) śp. Zygmunt Markowski wyszukiwarka Grobonet
Ordery i odznaczenia Krzyż Komandorski Orderu Odrodzenia Polski (8 listopada 1930) „za zasługi na polu nauki weterynaryjnej oraz rozwoju międzynarodowych stosunków w zakresie obrotu zwierzętami i zwalczania chorób zwierzęcych”. Wielki Oficer Orderu Leopolda II (Belgia)Tadeusz Jeziorowski: Belgijski Order Leopolda II... [w:] Nikodem Pajzderski, Muzealnik – konserwator – historyk sztuki, Poznań: 2014, s. 277. Krzyż Komandorski Orderu św. Sawy (Jugosławia)
Przypisy