Ołtarze boczne W kościele są cztery ołtarze boczne, po dwa z każdej strony, wykonane w stylu barokowym. Każdy zawiera obraz patrona, któremu jest poświęcony. Św. Liboriusza, biskupa Paderborn - ołtarz po lewej stronie, blisko wejścia do kościoła. Wykonany w 1795 przez Ermenegildo Grecha. Na ołtarzu stoi statuetka przedstawiająca Praskie Dzieciątko Jezus. Została ona podarowana w 2006 przez Rycerzy Świętego Jana z Pragi. Oryginał znajduje się w kościele Karmelitów Bosych w Pradze, zarządzanym przez Rycerzy Maltańskich. Św. Jana Ewangelisty - ołtarz po lewej stronie, bliżej apsydy. Bractwo św. Jana Ewangelisty powstało na Malcie w 1735. Po obu stronach ołtarza znajdują się wspaniałe owalne malowidła: Św. Jakub Większy z Matką Boską z Pilar oraz Anioł Stróż, przypisywane 18-wiecznemu maltańskiemu malarzowi Francesco Zahra (1710-1773). Św. Filipa Neri - ołtarz z 1648, naprzeciw św. Jana Ewangelisty (prawa strona nawy). Zawiera obraz Ekstaza św. Filipa Neri, jest najbardziej dekoracyjnym z ołtarzy, gdyż zbudowany jest z prawdziwego marmuru, kiedy inne są jedynie pomalowane "na marmur". Obok wiszą szafki z wotami dziękczynnymi. Ołtarz również jest obramowany dwoma owalnymi malowidłami: Św. Kamil z Lellis oraz Św. Franciszek de Paola, przypisywanymi bliskiemu uczniowi Francesco Zahra.