określał się jako niekonsekwentny marksista. Po wybuchu globalnego kryzysu finansowego zaczął często pojawiać się w mediach. W 2012 roku wyjechał z Grecji do USA i zaczął wykładać na University of Texas at Austin.
Od 2012 roku przez ponad rok pracował dla Valve Corporation jako główny konsultant ekonomiczny. Zajmował się konstruowaniem ekonomii wirtualnych światów, m.in. w grach Counter-Strike: Global Offensive, Dota 2 i Team Fortress 2, w tym przede wszystkim usprawnieniem systemu mikropłatności. Jego celem było umożliwienie połączenia dwóch wirtualnych gospodarek. Pracę tę uznał za „raj ekonomisty”, jako że przypominała mu sytuację Grecji względem Niemiec, a umożliwiała analizę wszystkich danych dotyczących aktywności ekonomicznej użytkowników.
25 stycznia 2015 roku wystartował z powodzeniem z listy Syrizy w wyborach do parlamentu. 27 stycznia tegoż roku został mianowany ministrem finansów w rządzie Aleksisa Tsiprasa. Wkrótce po objęciu urzędu oświadczył, że Grecja nie będzie negocjować z Europejskim Bankiem Centralnym, Międzynarodowym Funduszem Walutowym i Komisją Europejską, ale po kilku dniach wraz z całym rządem złagodził retorykę, zapowiadając dążenie do kompromisu. Janis Warufakis usiłował dążyć do dyskusji państw europejskich o redukcji greckiego zadłużenia.