Schedule for Affective Disorders and Schizophrenia (SADS), Structured Clinical Interview for DSM-IV (SCID) i Primary Care Evaluation of Mental Disorders (PRIME-MD).
Za swoją działalność naukową zyskał krajowe i międzynarodowe uznanie jako autorytet w diagnostyce i klasyfikacji zaburzeń psychicznych oraz otrzymał wiele nagród i odznaczeń m.in. Adolf Meyer Award (1987) i Award for Research in Psychiatry (1994) od Amerykańskiego Towarzystwa Psychiatrycznego czy Thomas William Salmon Medal (2000) od New York Academy of Medicine.
W 2003 roku na łamach „Archives of Sexual Behavior” zostało opublikowanie badanie Spitzera wskazujące na możliwość zmiany orientacji seksualnej z homoseksualnej na heteroseksualną w wyniku terapii reparatywnej. Stało się ono przedmiotem kontrowersji. Metodologia badania została skrytykowana m.in. za tendencyjny dobór próby i poleganie na samoopisach oraz retrospektywnych danych. W 2012 roku Spitzer przyznał, że fatalną wadą badania był brak możliwości oceny wiarygodności informacji pochodzących od jego uczestników o zmianie ich orientacji seksualnej.