W lipcu 2012 Manrique powrócił do Tiburones Rojos de Veracruz, tym razem występującego już jednak w drugiej lidze. Tym razem spędził w nim rok, będąc wyłącznie rezerwowym zespołu i nie odnosząc z nim większych sukcesów, po czym wraz z resztą drużyny przeniósł się do klubu Atlético San Luis z siedzibą w San Luis Potosí, który wykupił licencję jego dotychczasowego pracodawcy. Tam już po kilku tygodniach doznał poważnej kontuzji stawu biodrowego, wskutek której musiał pauzować przez pół roku, a bezpośrednio po tym, w wieku 35 lat, zdecydował się zakończyć piłkarską karierę.
Kariera trenerska Bezpośrednio po zakończeniu kariery Manrique rozpoczął pracę jako szkoleniowiec, jesienią 2014 trenując trzecioligowe rezerwy Atlético San Luis. W listopadzie 2014 zdecydował się jednak wznowić karierę piłkarską, podpisując umowę ze swoim byłym klubem, drugoligowym CD Irapuato. Mimo to dwa miesiące później, po upływie okresu przygotowawczego, ze względu na swoją słabą formę fizyczną i zaawansowany wiek ostatecznie zakończył karierę, dołączając do sztabu szkoleniowego Irapuato. W lutym 2015 zastąpił Roberto Sandovala na stanowisku trenera pierwszej drużyny, którą prowadził przez cztery kolejne miesiące, po czym klub został rozwiązany, przenosząc się do Los Mochis i zmieniając nazwę na Murciélagos FC.