Nowy większościowy rząd liderki socjaldemokratów rozpoczął funkcjonowanie 15 grudnia 2022.
W wyborach w 2026 jej formacja zajęła kolejny raz pierwsze miejsce, uzyskując jednakże najsłabszy wynik od wielu lat. Po wyborach doszło do najdłuższych w historii Danii negocjacji celem utworzenia kolejnego gabinetu (trwających około dziesięciu tygodni). Początkowo rozmowy prowadziła bez powodzenia Mette Frederiksen. W maju również bezskutecznie koordynował je lider liberałów Troels Lund Poulsen. W konsekwencji jeszcze w tym samym miesiącu prowadzenie negocjacji ponownie przejęła przewodnicząca socjaldemokratów. Ostatecznie 1 czerwca 2026 ogłoszono zawarcie mniejszościowej koalicji tworzonej przez cztery formacje: Socialdemokratiet, Socjalistyczną Partię Ludową, Moderaterne i Radykalną Lewicę. Poparcie zapewniające większość nowemu rządowi Mette Frederiksen w parlamencie zadeklarowały ugrupowania Czerwono-Zieloni i Alternatywa. Jej nowy gabinet rozpoczął funkcjonowanie 3 czerwca 2026.
Życie prywatne Rozwiedziona z pierwszym mężem, z którym ma dwoje dzieci. W 2020 zawarła związek małżeński z wieloletnim partnerem Bo Tengbergiem.