Jego innowacje w dziedzinie techniki operacyjnej to między innymi nowe metody szycia rozerwanej odbytnicy (metoda Kelly-Warren) i usuwania macicy w przypadku jej raka.
Pisał podręczniki aż do ukończenia 80. roku życia.
Kelly uważany jest za jednego z twórców ginekologii jako odrębnej medycznej specjalności zabiegowej.
Życie pozazawodowe Howard Atwood Kelly był ojcem dziewięciorga dzieci.
Kelly angażował się politycznie między innymi w ruch reformy procedury wyborczej. W ramach tego ruchu niejednokrotnie pełnił społecznie straż w lokalach wyborczych pilnując by nikt nie głosował wielokrotnie. Angażował się też w walkę z prostytucją i rehabilitację społeczną byłych prostytutek. W tym ostatnim celu wynajął duży dom i zatrudnił na swój koszt jego personel by zapewnić bezpłatne schronienie porzucającym swoje dotychczasowe zajęcie prostytutkom.
Jako gorliwy chrześcijanin wolny czas poświęcał między innymi ewangelizacji i czytaniu Biblii w oryginalnych językach greckim i hebrajskim. Przed rozpoczęciem każdej operacji zwykł zwoływać spotkanie modlitewne. Kelly był jednym z redaktorów chrześcijańskiej gazety The Christian Citizen. W latach 20. i 30.