W szpitalu leczy się około 37 tys. pacjentów rocznie. Placówka współpracuje w zakresie odbywania studenckich praktyk i pozyskiwania nowej kadry medycznej z Wydziałem Medycznym i Nauk o Zdrowiu Uniwersytetu Kaliskiego im. Prezydenta Stanisława Wojciechowskiego w Kaliszu. W 2025 roku władze szpitala i uczelni podpisały porozumienie, na mocy którego w przyszłości Wojewódzki Szpital Zespolony im. Ludwika Perzyny w Kaliszu zostanie przekształcony w Szpital Kliniczny Uniwersytetu Kaliskiego. Docelowo wszystkie oddziały mają stać się oddziałami klinicznymi, choć sam szpital ma nie zmienić struktury właścicielskiej.
W 2015 szpital dzięki wsparciu Urzędowi Marszałkowskiemu Województwa Wielkopolskiego kwotą ponad 11 mln złotych otrzymał innowacyjną aparaturę medyczną m.in. neuronawigację do skomplikowanych operacji na mózgu.
1 lutego 2016 w szpitalu przy ul. Toruńskiej otwarto Oddział Onkologii Klinicznej, połączony bezpośrednio z budynkiem Ośrodka Radioterapii.
Przy szpitalu znajduje się lądowisko Kalisz, przeznaczone dla śmigłowców sanitarnych i ratowniczych.