Zniesienie kontroli we wszystkich przejściach na granicach wewnętrznych Unii Europejskiej, miało wpływ na kolejne zmiany w systemie organizacyjnym ochrony północno-zachodnich rubieży państwa i 15 kwietnia 2008 z rozformowanej Placówki SG w Trzebieży, włączono do struktur organizacyjnych Placówki SG w Szczecinie-Porcie, porty morskie w Trzebieży i Nowym Warpnie.
W związku z utworzeniem, w strukturach Pomorskiego Oddziału SG Placówki SG w Szczecinie, 1 października 2009 zmienił się rejon działania Placówki SG w Szczecinie-Porcie.
Po rozformowaniu Pomorskiego Oddziału SG w Szczecinie, z dniem 1 stycznia 2010 Placówka SG w Szczecinie-Porcie została włączona w struktury Nadodrzańskiego Oddziału Straży Granicznej z siedzibą w Krośnie OdrzańskimRozporządzenie ministra spraw wewnętrznych i administracji z 10 września 2009. w sprawie zniesienia niektórych oddziałów Straży Granicznej oraz decyzja nr 167 ministra spraw wewnętrznych i administracji z 1 października 2009 w sprawie likwidacji państwowej jednostki budżetowej – Pomorskiego Oddziału Straży Granicznej w Szczecinie..