W eliminacjach do Pucharu Narodów Afryki 2017 wzięły udział 52 afrykańskie reprezentacje państwowe. W kwalifikacjach uczestniczyła reprezentacja Gabonu, która posiadała pewne miejsce w fazie grupowej jako gospodarz turnieju Puchar Narodów Afryki 2017. Z tej przyczyny jej mecze były traktowane jako spotkania towarzyskie.
Zasady Losowanie kwalifikacji odbyło się 8 kwietnia 2015 roku w Kairze.
Ze względu na wycofanie się Maroka z organizacji pucharu w 2015, Maroko było pierwotnie wykluczone przez CAF z turniejów w 2017 i 2019 roku. Jednak zakaz został anulowany przez Trybunał Arbitrażowy do spraw Sportu, co oznacza, że Maroko weźmie udział w eliminacjach.
Uczestnicy Lista reprezentacji biorąca udział w kwalifikacjach
Koszyk nr 1Koszyk nr 2Koszyk nr 3Koszyk nr 4 (56 pkt) (52 pkt) (35,5 pkt) (34 pkt) (34 pkt) (33,5 pkt) (32 pkt) (31 pkt) (29,5 pkt) (28 pkt) (26 pkt) (24 pkt) (23,5 pkt) (23,5 pkt) (23 pkt) (22 pkt) (19 pkt) (17 pkt) (15 pkt) (14,5 pkt) (14 pkt) (13 pkt) (12,5 pkt) (12,5 pkt) (12 pkt) (11,5 pkt) (11 pkt) (11 pkt) (9,5 pkt) (9 pkt) (6 pkt) (6 pkt) (5,5 pkt) (5,5 pkt) (5,5 pkt) (5,5 pkt) (5 pkt) (4,5 pkt) (4,5 pkt) (4 pkt) (3,5 pkt) (3 pkt) (3 pkt) (2,5 pkt) (2,5 pkt) (2,5 pkt) (2 pkt) (1,5 pkt) (1,5 pkt) (1 pkt) (0,5 pkt) (0 pkt)