W latach 90. XX wieku linia wyrobów została rozszerzona o zawory procesowe, czujniki i przepływomierze masowe, co uczyniło firmę kompleksowym dostawcą produktów techniki przepływowej. Doszły do tego komponenty i systemy do automatyzacji procesów. W tym samym okresie opracowano małe zawory elektromagnetyczne z separacją medium dla zastosowań z zakresu nauk przyrodniczych, które pomogły zdobyć nowe obszary działalności w gabinetach stomatologicznych i szpitalach. Od 1993 roku w Großröhrsdorf k. Drezna działa pierwsze z centrów badawczo-rozwojowych, w których Bürkert produkuje kompletne systemy na zlecenie klientów. Kolejne tego rodzaju placówki powstały w Niemczech – w Ingelfingen-Criesbach (2007) i Menden k. Dortmundu. Do tego doszły lokalizacje zagraniczne w Charlotte (Karolina Północna, Stany Zjednoczone), Suzhou (Chiny) oraz w Indiach.
W 2007 roku w głównej siedzibie w Ingelfingen powstało centrum innowacji. W 2014 roku firma wdrożyła wewnętrznie platformę Efficient Device Integration Platform (EDIP), co oznaczało wejście w obszar Przemysłu 4.0. Rok później Bürkert rozszerzył działalność w zakresie napełniania wysokoczystych i wrażliwych mediów.