Na wyraźnej dominancie grzbietu Wielkiej Fatry, jaką jest Čierny kameň, zachowały się fragmenty pierwotnych lasów, porastających kiedyś całą tę grupę górską. Na stosunkowo małej powierzchni rezerwatu możemy prześledzić naturalne następstwo pięter roślinnych od górnych partii regla dolnego z lasami bukowo-jaworowymi z domieszką jodły i świerka poprzez górnoreglowe bory świerkowe z udziałem jarzębiny przy górnej granicy lasu aż po piętro subalpejskie z największymi w całej Wielkiej Fatrze porostami reliktowej kosodrzewiny z jarzębem nieszpułkowym. Średni wiek drzew szacuje się tu na ok. 170 lat, natomiast najstarsze drzewa sięgają wieku 250 lat. Obwody największych drzew osiągają tu u świerka 420 cm, u jodły 350 cm, u buka 340 cm, u jawora 330 cm. Skały wapienne i dolomitowe są siedliskiem wielu rzadkich i chronionych gatunków roślin wapieniolubnych, jak pierwiosnek łyszczak, szarotka alpejska, jaskier alpejski czy endemit Karpat Zachodnich – goździk lśniący.