7 września 2007 odbył się mecz towarzyski FC Erzgebirge Aue – Lech Poznań (2:4) z okazji zakończenia kariery piłkarskiej przez Andrzeja Juskowiaka.
Po zakończeniu kariery podjął się współkomentowania meczów i roli eksperta w kanałach telewizyjnych Polsat Sport, Orange Sport, Eurosport i TVP między innymi podczas mistrzostw świata w piłce nożnej 2018, mistrzostw Europy w piłce nożnej 2012, 2020 i Ligi Mistrzów UEFA. Od 5 czerwca 2009 do 3 stycznia 2011 roku pełnił funkcję trenera napastników Lecha Poznań. Został także prezesem poznańskiego klubu TPS Winogrady. 11 lutego 2014 został członkiem zarządu Lechii Gdańsk odpowiedzialnym za sprawy sportowe. 6 października 2014 został zwolniony ze stanowiska wiceprezesa ds. sportowych Lechii Gdańsk. Od 2016 zajmuje się także skautingiem w Lechu Poznańhttps://www.lechpoznan.pl/aktualnosci,2,juskowiak-wzmocnil-skauting-kolejorza,25259.html Informacja na lechpoznan.pl. Od 2018 jest komentatorem i ekspertem Ekstraklasy na antenach kanałów sportowych Canal+. Często gości w programie Liga+.