Współautor książek pt.: Kto naprawdę ich zabił? (2010), dotyczącej katastrofy polskiego Tu-154 w Smoleńsku, Nietykalni. Kulisy polskich prywatyzacji. Prawdziwa historia gospodarcza III RP (2014) i Jan Kulczyk. Biografia niezwykła (2015). Autor publikacji Jak rozpętałem aferę taśmową (2014), za którą otrzymał 30 stycznia 2015 „Nagrodę Watergate” za rok 2014 przyznaną przez Stowarzyszenie Dziennikarzy Polskich. W 2016 r. ukazała się jego piąta książka Skok na banki. Kto kontroluje pieniądze Polaków, kompleksowa publikacja o historii sektora bankowego w Polsce. Z kolei w 2019 r. ukazała się jego książka Rekiny Wojny Kto naprawdę zarabia na handlu polską bronią?, opisująca kulisy kontraktów eksportowych zawieranych przez państwowe przedsiębiorstwo zbrojeniowe Bumar (obecnie Polski Holding Obronny).
Według publikacji dziennikarskich Wojciecha Surmacza (2014), Jana Pińskiego, Elżbiety Rutkowskiej, Grzegorza Kopacza (2017), Tomasza Szwejgierta (2020) Piotr Nisztor był tajnym współpracownikiem Centralnego Biura Antykorupcyjnego. On sam zaprzeczył tym twierdzeniom i złożył zawiadomienie o popełnieniu przestępstwa z art.