W 1981 obchodzono 20-lecie istnienia szkoły.
W pierwszej połowie lat 80. przy szkole powstały warsztaty, których wykonawcą było Sanockie Przedsiębiorstwo Budowlane. W 1988 zapoczątkowano trzyletnie technikum dla absolwentów szkół zawodowych, a od 1991 pięcioletnie technikum dla absolwentów szkół podstawowych. Od 1991 szkoła funkcjonowała pod nazwą Zespół Szkół Technicznych. Od 1995 utworzono w ramach szkoły Informatyczne Centrum Doskonalenia Zawodowego, wprowadzono kształcenie dla dorosłych, szkołę policealną (Policealne Studium Zawodowe), liceum zawodowe. Od 1999 działało technikum mechaniczne trzy- i pięcioletnie, liceum zawodowe, liceum techniczne oraz studium zawodowe i policealne. W 2002 szkoła została przemianowana na Zespół Szkół nr 3. Od tego czasu zostały wprowadzone: liceum ogólnokształcące o profilu matematyczno-informatycznym, czteroletnie oraz trzyletnie technikum mechaniczne, liceum profilowane, dwuletnia zasadnicza szkoła zawodowa. 30 sierpnia 2010 decyzją Rady Pedagogiczne przemianowano nazwę na Zespół Szkół nr 3 im. Walentego Lipińskiego i Mateusza Beksińskiego w Sanoku.