Nagrał również filmy dokumentalne pokazane w BBC 2 The Lost Treasure of Jerusalem (1972), The Priest, the Painter and the Devil (1974) oraz The Shadow of the Templars (1979).
Święty Graal i Święta Krew Henry Lincoln jest współautorem kontrowersyjnej książki "Święty Graal i Święta krew" razem z Michaelem Baigentem i Richardem Leigh. Autorzy poznali się w 1970, gdy Michael pracował nad projektem na temat Zakonu Templariuszy. W trójkę stworzyli teorię, według której Jezus Chrystus miał z Marią Magdaleną bliskie kontakty. Po ukrzyżowaniu Chrystusa, Maria miała dotrzeć łodzią na południe Francji i urodzić dziecko Jezusa, które poprzez późniejsze małżeństwa zapoczątkowało ród Merowingów – francuską rodzinę królewską.
Proces sądowy Część z pomysłów z książki "Święty Graal i Święta Krew" zostało zaprezentowanych w przez Dana Browna w Kodzie Leonarda da Vinci.
W 2006 Baigent i Leigh złożyli pozew przeciwko wydawcy książki Browna, Random House, posądzając wydawcę o naruszenie praw autorskich.