Według jednej z wersji wydarzeń Roy Toombs został nadzwyczaj szybko przyjęty do Cerkwi Zagranicznej, gdyż w czasie II wojny światowej pracował dla rządu amerykańskiego i przyczynił się do umożliwienia jej hierarchom wjazdu do Stanów Zjednoczonych i pozostanie tam. Przybyciu duchownych Cerkwi Zagranicznej sprzeciwiała się Metropolia Amerykańska oraz ZSRR, prawdopodobnie sugerując, że biskupi Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego poza granicami Rosji byli winni kolaboracji z Hitlerem.
W 1951 Roy Toombs rozstał się ze swoją żoną, oboje złożyli wieczyste śluby mnisze. Jego postrzyżyny mnisze odbyły się w monasterze Trójcy Świętej w Jordanville, przyjął imię zakonne Jakub. 12 lipca 1951 w Nowej Pustelni Korzennej został wyświęcony na biskupa Manhattanu, wikariusza eparchii wschodnioamerykańskiej. Jakub (Toombs) niemal natychmiast otrzymał godność arcybiskupa, powierzono mu prowadzenie misji wśród Amerykanów, nadając mu szerokie uprawnienia. Nie będąc formalnie członkiem Synodu biskupów, hierarcha brał udział w jego posiedzeniach. Wbrew oficjalnemu stanowisku Kościoła przyjmował nowych wiernych do Kościoła po przyjęciu powtórnego chrztu, podczas gdy w przypadku katolików wystarczyłaby spowiedź.