Edward Herbert Thompson (ur. 28 września 1856 w Worchester w stanie Massachusetts, zm. 11 maja 1935 w Plainfield w stanie New Jersey) – amerykański archeolog i dyplomata, specjalista z zakresu historii i kultury Majów.
Życiorys Zainteresowanie archeologią zaszczepiła w nim prawdopodobnie matka Gladwin, z którą jeszcze jako dziecko, wspólnie poszukiwał grotów strzał w pobliskich strumieniach. Później na farmie swojego wujka odnalazł wraz z przyjacielem kilka indiańskich artefaktów, które przekazał Stowarzyszeniu Historii Naturalnej Hrabstwa Worcester. Nigdy jednak nie posiadł formalnego wykształcenia archeologicznego. Przez długi czas bronił popularnego ówcześnie pseudonaukowego poglądu o pochodzeniu cywilizacji mezoamerykańskich z Atlantydy, m.in. w opublikowanym w 1879 roku na łamach Popular Monthly artykule Atlantis Not a Myth. Zwrócił nim uwagę Stephena Salisbury’ego Jr., który był wiceprzewodniczącym Amerykańskiego Stowarzyszenia Antykwarskiego. W 1885 roku Salisbury poinformował go, że stowarzyszenie oraz Peabody Museum postanowiło mianować go badaczem starożytnych kultur na Jukatanie. W latach 1885–1909 dzięki wsparciu senatora George’a Frisbie Hoara pełnił funkcję amerykańskiego konsula w Mérida na Jukatanie.