W 2019 przeszedł do Genoi, w której zadebiutował w Serie A 15 września w przegranym 1:2 meczu z Atalantą.
W 2020 Ankersen wrócił do FC København. W pierwszym meczu po powrocie (2:2 z Vejle BK) strzelił jedną z bramek. W 2022 i 2023 jego zespół wywalczył mistrzostwo Danii, a w 2023 zdobył również puchar kraju. 1 czerwca 2024 FC Nordsjælland ogłosił, że Ankersen zostanie piłkarzem tego klubu od sezonu 2024/25.
Stan na 1 lipca 2024 Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 2009/10 Esbjerg fB Superligaen 1 0 2010/11 Vejle BK 1. division 28 1 2011/12 Vejle Boldklub Kolding 13 2 2012 Rosenborg BK Tippeligaen 10 0 2012/13 Esbjerg fB Superligaen 26 3 2013/14 30 2 2014/15 Red Bull Salzburg Bundesliga 21 1 2015/16 FC København (wyp.) Superligaen 30 0 2016/17 FC København 32 5 2017/18 30 2 2018/19 34 1 2019/20 Genoa CFC Serie A 19 0 2020/21 FC København Superligaen 21 2 2021/22 28 1 2022/23 12 0 2023/24 21 1
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Danii Ankersen zadebiutował 14 sierpnia 2013 w przegranym 2:3 meczu towarzyskim z Polską, rozegranym w Gdańsku.
Życie prywatne Brat bliźniak Jakoba, również piłkarza.