Czołowi liderzy społeczni podjęli pozytywne działania na rzecz promowania wolności religijnej.
Chrześcijaństwo thumb|250px|Ceremonia chrztu w Niebiańskim Kościele Chrystusa w Cotonou.
Wyznawców chrześcijaństwa, islamu i tradycyjnych religii plemiennych można znaleźć w całym kraju. Jednak chrześcijanie są powszechnie na południu, szczególnie w stolicy gospodarczej Cotonou.
Więcej jak połowa chrześcijan w Beninie to katolicy. Drugą co do wielkości gałęzią chrześcijaństwa reprezentowaną przez wiele wyznań i denominacji jest protestantyzm. Istnieje także liczne grono wiernych afrykańskich Kościołów, wśród których wyróżnia się Niebiański Kościół Chrystusa. Swoją działalność prowadzą tutaj także Świadkowie Jehowy (14 tys. głosicieli).
Według Joshua Project do najbardziej schrystianizowanych plemion należą: Fonowie, Gun i Ewe.
Katolicyzm
Pierwsza obecność chrześcijaństwa w kraju odnotowana jest w 1680 roku kiedy portugalscy misjonarze wybudowali kaplicę w Ouidah. Samo dzieło ewangelizacji rozpoczęło się dopiero wraz z przybyciem katolickich misjonarzy Stowarzyszenia Misji Afrykańskich w 1860 roku, kiedy założono misję w Porto-Novo i Agou.