W wiosennych rozgrywkach Apertura 2008 osiągnął ze swoją ekipą tytuł wicemistrzowski, zaś pół roku później, w jesiennym sezonie Finalización 2008 zdobył z Américą swoje pierwsze mistrzostwo Kolumbii, pozostając kluczowym graczem drużyny Diego Umañi.
Latem 2009 Valdés przeszedł do zespołu Independiente Santa Fe ze stołecznej Bogoty, gdzie spędził półtora roku w roli podstawowego piłkarza, w 2009 roku zdobywając krajowy puchar – Copa Colombia. W styczniu 2011 wyjechał do Stanów Zjednoczonych, zostając zawodnikiem tamtejszego klubu Philadelphia Union, prowadzonego przez Piotra Nowaka. W drużynie z Filadelfii występował razem z pięcioma rodakami – Juanem Diego Gonzálezem, Farydem Mondragónem, Lionardem Pajoyem, Jorge Perlazą i Rogerem Torresem. W Major League Soccer zadebiutował 19 marca 2011 w wygranym 1:0 spotkaniu z Houston Dynamo, zaś premierowego gola strzelił 17 lipca tego samego roku w wygranej 3:0 konfrontacji z New England Revolution. W lipcu 2012 wystąpił w pokazowym meczu gwiazd ligi MLS przeciwko Chelsea (3:2), a przez cały swój dwuletni pobyt w Union miał niepodważalną pozycję w linii defensywy, jednak nie potrafił nawiązać do sukcesów odnoszonych z poprzednimi zespołami.