Zadania, jakie miał wypełniać batalion, a co za tym idzie wyposażenie go w ciężki sprzęt mechaniczny wymagały posiadanie wysokiej klasy specjalistów. Plan szkolenia opracowany w Dowództwie Saperów 2 Korpusu i Dowództwie Grupy Saperów kładł szczególny nacisk na szkolenie specjalistów, którzy stanowili prawie 80% stanu osobowego jednostki. Od 5 czerwca 1945 roku do 3 czerwca 1946 roku 493 szeregowych ukończyło różnego rodzaju kursy organizowane przez inne jednostki 2 KP. Poza tym w baonie prowadzono intensywne szkolenie i doskonalenie na właściwym sprzęcie. Plan szkolenia batalionu zakładał, że każdy żołnierz obok posiadanej specjalności musiał zdobyć podstawową wiedzę saperską.
Kompania saperów drogowych niezależnie od normalnych prac saperskich (wykonywanych przez dywizyjne kompanie saperów), była przygotowana do budowy dróg i mostów, obliczonych na duże obciążenia, we wszelkich warunkach terenowych, przy użyciu ciężkiego sprzętu mechanicznego - tak na tyłach oddziałów jak i w sferze przyfrontowej.
Zadaniem 21 kompanii saperów była budowa ciężkich mostów w trudnych warunkach terenowych, współpraca z jednostkami innych broni w działaniach bojowych, a także wzmocnienie dywizyjnych jednostek saperskich.