Drugi Doktor () – postać fikcyjna związana z brytyjskim serialem science-fiction pt. Doktor Who, w którą wcielał się Patrick Troughton. Drugi Doktor był drugą inkarnacją oryginalnego cyklu regeneracyjnego jaki posiadał Doktor, główny bohater serialu. Postać ta regularnie pojawiała się w latach 1966-1969 (co łącznie składa się na 3 sezonyDrugi Doktor nie wystąpił w całym sezonie 4. Jego postać została wprowadzona dopiero w czwartym odcinku drugiej historii tego sezonu) oraz gościnnie w historiach The Three Doctors (1973), The Five Doctors (1983) oraz The Two Doctors (1985).
Historia postaci Pierwszy Doktor, w wyniku wyczerpania fizycznego i zawału (prawdopodobnie przyczyną był jego podeszły wiek), odnowił swoje ciało w procesie regeneracji i przekształcił się w Drugiego Doktora.
W tym wcieleniu Doktor ponownie spotkał starych wrogów – Daleków i Cybermenów, ale zyskał również nowych przeciwników m.in. Wielką Inteligencję i Lodowych Wojowników. W międzyczasie poznał Alistaira Gordona Lethbridge-Stewarta, żołnierza, który później został mianowany przywódcą brytyjskiego oddziału UNIT.