Do najświetniejszych czynów tego batalionu zaliczyć należy obronę Lwowa – Persenkówki. 13 stycznia 1919 roku w czasie wypadu na Kozice i Damanyż zginął śmiercią bohaterską dowódca 1 kompanii saperów podporucznik Marian Ejzert. 17 i 18 lutego 1919 w czasie wypadu na Korzec ginie podporucznik Ludwik Nebelski. 20 czerwca 1920 r., ginie wraz z całym plutonem podporucznik Kazimierz Gawkowski. Szlak marszu 3 batalionu saperów to Lwów–Wilno–Dźwińsk–Kijów–Warszawa.
W 1921 roku III bsap został włączony w skład 2 pułku saperów kaniowskich w Puławach. W 1925 roku w skład III bsap została włączona jedna z kompanii zlikwidowanego XXVII bsap. Kompania ta została przemianowana na 3/III bsap.
W 1929 roku batalion został rozformowany.
Żołnierze batalionu
Dowódcy batalionu kpt Artur Włodzimierz Górski (20 XI 1918 – I 1919 ?) por. Stanisław Perko (p.o. od XII 1919) por. Stanisław Arczyński (1920 - VIII 1925) mjr Zenon Lenczewski (VIII 1926 – XII 1929)