Później pełnił identyczną funkcję w Obornikach, ale w maju 1926 na własną prośbę został przeniesiony przez wojewodę z powrotem do Gołańczy. Po utworzeniu w administracji urzędu wójtowskiego 29 maja 1928 został mianowany na wójta obwodu wójtowskiego w Gołańczy. Na tym ostatnim stanowisku pracował do 1931, a od 1930 ponownie zasiadał w wągrowieckim Sejmiku Powiatowym (aż do 1939).
W kolejnych latach do wybuchu II wojny światowej był zarządcą majątków. Sąd Grodzki w Wągrowcu wyznaczył go w 1932 na przymusowego zarządcę w Laskownicy Małej. Czajkowski prowadził ponadto m.in. majątki Modrzewie (własność Wiktorii Sikorzyny) i Oleszno, gdzie zastał go wrzesień 1939. Okres II wojny światowej spędził w Wągrowcu, częściowo u rodziny, w trudnych warunkach materialnych.
Od 1945 był pełnomocnikiem wągrowieckiego oddziału Polskiego Czerwonego Krzyża, później pracował jako administrator kilku nieruchomości w Wągrowcu. Był także pełnomocnikiem dyrektora Państwowego Liceum Pedagogicznego ds. likwidacji szkolnego gospodarstwa rolnego w Sadach.