1 stycznia 1960 batalionowi WOP Gubin podlegały: 10 strażnica WOP II kategorii Żytowań 11 strażnica WOP I kategorii Gubin 12 strażnica WOP I kategorii Sękowice 13 strażnica WOP III kategorii Polanowice 14 strażnica WOP II kategorii Strzegów.
Struktura batalionu i numeracja strażnic na dzień 1.01.1964. 9 strażnica WOP lądowa II kategorii Żytowań 10 strażnica WOP lądowa I kategorii Gubin 11 strażnica WOP lądowa I kategorii Sękowice – rozformowana w 1966 12 strażnica WOP lądowa III kategorii Polanowice 13 strażnica WOP lądowa II kategorii Strzegów
W marcu 1968 batalionowi technicznemu WOP Gubin podlegały: Strażnica techniczna WOP nr 9 Żytowań typ I Strażnica techniczna WOP nr 10 Gubin typ II Pluton kontroli ruchu granicznego Gubin Szkolna strażnica techniczna Gubin Strażnica techniczna WOP nr 11 Polanowice typ I Strażnica techniczna WOP nr 12 Strzegów typ III.
Struktura w latach 80: Dowództwo, sztab i pododdziały batalionowe – Gubin Strażnica WOP Sobolice Strażnica WOP Przewóz Strażnica WOP Łęknica Strażnica WOP Olszyna Strażnica WOP Zasieki Strażnica WOP Strzegów Strażnica WOP Polanowice Strażnica WOP Gubin Strażnica WOP Żytowań.