Flow była nominowana do nagród Game Developers Choice Awards za rok 2008 w kategoriach Innovation Award (nagroda za innowację) oraz Best Debut (najlepszy debiut), a zdobyła wyróżnienie w kategorii Best Downloadable Game (najlepsza gra do pobrania). Nominowały ją także Akademia Sztuk i Nauk Interaktywnych w kategorii Best Downloadable Game of the Year (najlepsza gra roku do pobrania, za rok 2008) oraz Brytyjska Akademia Sztuk Filmowych i Telewizyjnych w kategorii Best Innovation (najlepsza innowacja, za rok 2007). Muzyka do gry uzyskała nominację dla najlepszej muzyki interaktywnej oraz najbardziej innowacyjnego użycia dźwięku od amerykańskiej organizacji, a kompozytor Austin Wintory zdobył nagrodę Rookie of the Year (debiut roku). Flow była finalistą konkursu Slamdance Guerrilla Games Competition na Festiwalu Filmowym w Slamdance, ale została wycofana z konkursu wraz z kilkoma innymi finalistami, gdy jury festiwalu zdecydowało o usunięciu z rywalizacji gry Super Columbine Massacre RPG!. W 2011 roku Flow została wyselekcjonowana głosami publiczności jako jedna z 80 gier, które zostały pokazane przez Smithsonian American Art Museum w 2012 roku na wystawie „The Art of Video Games”.