W 1995 Związek zmienił nazwę na Związek Piłki Nożnej Republiki Serbskiej.
Tak jak Związek Piłki Nożnej Republiki Serbskiej nie mógł być przyjęty do FIFA i UEFA, a więc kluby i drużyna narodowa, wchodzące do składu Związku, nie uczestniczyły w turniejach oficjalnych.
23 maja 2002 Fudbalski savez Republike Srpske oraz Nogometni/Fudbalski Savez Bosne i Hercegovine udało się wynegocjować rozwiązanie tego problemu, a 4 sierpnia 2002 rozpoczęły się mistrzostwa Bośni i Hercegowiny w piłce nożnej, w których debiutowały kluby z Republiki Serbskiej. Uzgodniono również, że kierować Związkiem Piłki Nożnej Bośni i Hercegowiny będą Serb, Bośniak i Chorwat w celu przestrzegania podstawowych postanowień konstytucji Bośni i Hercegowiny.
Przez długi czas był Prezesem Związku Piłki Nożnej Republiki Serbskiej był Milan Jelić, Prezydent Republiki Serbskiej. Po jego przedwczesnej śmierci, 30 listopada 2007 r. Prezesem został prawnik Mile Kovacević. Siedziba Związku znajduje się w Banja Luce.
Rozgrywki organizowane przez FSRS Pod patronatem związku są organizowane następujące rozgrywki: