Osobowość prawną zyskała w 1998 roku, kiedy stało się spółką z ograniczoną odpowiedzialnością, której jedynym właścicielem był PGNiG SA. W lipcu 2012 roku przedsiębiorstwo zostało przekształcone w spółkę akcyjną. Z dniem 1 sierpnia 2016 Geofizyka Kraków jest w likwidacji.
W 2008 roku pracownik spółki, Piotr Stańczak został porwany i w 2009 roku zamordowany w Pakistanie.
Działalność Siedziba główna Geofizyki Kraków mieści się w Krakowie przy ul. Łukasiewicza 3, na Olszy. W Krośnie mieści się Baza Geofizyki Wiertniczej, przedsiębiorstwo ma także dwie grupy pomiarowe geofizyki wiertniczej. Oddziały zagraniczne przedsiębiorstwa znajdują się na Słowacji, w Czechach, Libii, Pakistanie, Omanie i Gruzji. Na stałe przedsiębiorstwo zatrudnia około 500 osób.
Geofizyka Kraków jest kontraktorem geofizycznym, czyli firmą usługową, która prowadzi badania na zlecenie firm poszukujących węglowodorów lub wód geotermalnych, a także firm z branży wydobywczej i górnictwa. Firma prowadzi przede wszystkim badania sejsmiczne, zarówno 2D, jak i 3D. Geofizyka Kraków specjalizuje się w sejsmice lądowej. Oferuje swoim klientom kompleksowe usługi, od momentu projektowania badań, przez akwizycję danych sejsmicznych, aż po przetwarzanie i interpretację danych. W badaniach stosuje głównie wibratorową metodę wzbudzania fali sejsmicznej.